El edificio donde funciona el Museo Histórico Geográfico y Natural de Virasoro perteneció al capataz de estación local, durante el auge del ferrocarril. La arquitectura del mismo es de estilo inglés al igual que las demás construcciones del predio, que datan de 1910 y 1911. La casa está construida con ladrillos y tiene baldosas de arenisca.

Al giual que las estaciones de las zona, el edificio posee elementos de construcción autóctonos como ser las rocas itacurú (Ita: piedra + curú: agujero= piedra con agujero); estas piedras también eran utilizadas como material de construcción en las reducciones jesuíticas.

Fue inaugurado como Museo Histórico Geográfico y Natural el 23 de septiembre de 2001.

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